Cerita berawal dari kisah 26 tahun yang lalu, dimana saat itu seorang siswi bernama Misaki tengah menempuh tahun ketiganya di sebuah sekolah menengah.Sebagai siswa teladan yang juga pandai olahraga, gadis cantik ini menjadi sangat populer diantara teman sekelasnya.Hingga suatu hari, Misaki dikabarkan meninggal secara tiba-tiba.
Teman-teman sekelasnya yang tidak bisa menerima kepergian Misaki, memutuskan untuk melanjutkan tahun terakhir mereka dengan seolah-olah menganggap Misaki masih hidup sampai waktu kelulusan.
Kemudian, setting berganti pada musim semi tahun 1998, di mana seorang siswa transfer bernama Sakakibara Kouichi pindah ke sekolah tersebut.Ia dihadapkan pada suasana yang mencekam didalam kelas bekas Misaki itu, serta bertemu dengan gadis cantik penyendiri yang selalu memakai penutup mata, yang juga bernama Misaki.